"Первым мужем актрисы был Анатолий Агамиров — музыкальный критик. Они познакомились на съёмках фильма «Расскажи мне о себе», на котором работала хореографом его мать.
В начале 1970-х брак себя исчерпал, и актриса вышла замуж за ленинградского психиатра Эрнеста Лейбова, родила дочь Катю. Этот союз просуществовал три года. В 1975 году Лейбов эмигрировал в США, а уезжать вместе с мужем она не захотела.
Следующий брак с литератором Евгением Козловским счастья тоже не принёс. Евгений Козловский, известный своим романом «Мы встретились в раю», диссидентствовал и публиковался на Западе, за что и был преследуем КГБ. В квартире было три обыска — вещи, вплоть до детских книг, трижды вывозились. Когда Козловского посадили, актрису стали вызывать на допросы на Лубянку. Дальнейшие годы актриса жила в одиночестве, поскольку дочь рано вышла замуж, и отношения с ней разладились.
В жизни она всегда оставалась человеком закрытым и одиноким, несмотря на признание коллег. В последние годы жизни злоупотребляла спиртным.
За год до смерти подверглась нападению грабителя, который придушил её. Актрисе вовремя оказали помощь, но её дыхательные пути были повреждены. Она стала задыхаться и часто оказывалась в больнице с диагнозом астма. Никищихиной запретили есть твёрдую пищу.
Скончалась на 57-м году жизни в коммунальной квартире, где проживала последние годы. Как показала экспертиза, причиной смерти стала асфиксия, наступившая в результате попадания яблока в дыхательные пути.